1 сентября 1995 г. был основан богословский факультет ЕГУ. Деканом-основателем факультета является почетный доктор НАН РА и ЕГУ, доктор философии и филологии, профессор, арх. Шаге Ачемян.

В составе факультета действуют 3 специальные кафедры – богословия, теории и истории религии, истории и экклезиологии Армянской церкви (с 2006/07 учебного года) а также единственная в своем роде в республике специальная библиотека “Библиотека Ачемян”.

Преподавание специальных курсов осуществляется на факультете в 4 основных направлениях: введение в Библию и ее трактование (введение в Ветхий и Новый Заветы, трактование Ветхого и Нового Заветов), “Теоретическое богословие” (вардапетское богословие, патрология, армянская богословская письменность), “Историческое богословие” (общая история церкви, история Армянской церкви, этика, история религий), “Практическое богословие” (религиоведение, хронология, этическое богословие, ритуалогия).

С 2004 года деканом факультета является епископ Анушаван Жамкочян. При новом декане не только были продолжены лучшие традиции, но и были претворены в жизнь великолепные инициативы.

С 2006 года издаются факультетские научно-педагогические издания «Тарегирк» и «Ай аствацабан», в которых публикуют свои работы преподаватели и аспиранты богословского, исторического и филологического факультетов, было восстановлено издание серии «Ачемян».

Библиотека-кабинет богословия «Ачемян» была пополнена вторым читальным залом.

Были открыты новые компьютерный и лингафонный залы.

Стало традицией проведение практики в различных священных местах Армении, а также участие студентов в самых различных праздничных обрядах.

Продолжаются межуниверситетские отношения с европейскими вузами, в том числе в университетами Страсбурга и Алеппо. На факультете не только периодически преподают богословы, имеющие мировое признание, но и наши лучшие студенты продолжают свое обучение в этих университетах.

Преподавательский состав пополнился специалистами, имеющими различные ученые степени и пользующиеся международным признанием. Молодые же специалисты, являющиеся в большинстве своем нашими выпускниками, уже получили ученые степени.

Две аудитории факультета были отремонтированы и названы именами погибших в карабахской войне воинов-освободителей – Вардана Азатовича Бахшьяна и Вардана Тиграновича Даллакяна, а одна аудитория – именем блаженной памяти Католикоса всех армян Вазгена I Палчяна.

Студсовет и СНО факультета лучшими начинаниями делают научную жизнь и будни студентов интереснее и разнообразнее.