Преподавание химии было начато в университете еще в 1921 г.
Оно осуществлялось новосозданной кафедрой химии, где начали свою деятельность на благо нации С. Гамбарян, А. Акопян, Л. Ротинян и Г. Акунян.

В этой работе также принимали участие декан факультета, агрохимик П. Калантарян и действующий в те годы ректор ЕГУ, биохимик Г. Оганесян.

Объединенной кафедрой химии долгие годы руководил профессор С. Гамбарян. Кафедра по своей природе с самого начала становится кафедрой органической химии, научная направленность которой связана с изучением взаимовлияния супероксидов, исследования с успехом продолжаются по сей день.

На кафедре также велись изучения местных горючих сланцев, эфирномасличных растений. С 1927 г. объединенная кафедра делится на кафедры органической и физической химии.

Факультет химии в качестве самостоятельного звена университета формируется в 1933 г. В 1934 г. его возглавляет профессор Г. Тер-Газарян.

В 1993 г. на базе факультета химии осуществляется подготовка кадров по новой специальности - “химия и охрана природы”, а в 1994-ом – и по специальности “фармакохимия”.

На факультете обсуждаются и рецензируются школьные химические программы и критерии, различные учебные работы, пособия и учебники.

Факультет химии является международно признанным научным центром.

Факультет установил тесные связи с ведущими научными центрами различных стран: в США – с Северо-западным университетом (Эванстон), Аризонским университетом (Тюсон), университетом Калифорнии (Дэвис), в Германии – с университетами Ростока, Мюнстера, Карлсруэ, Регенсбурга, Бохума, в Англии – с Лондонским университетом, колледжем Бербек, в Италии – с Болонским университетом, во Франции – с университетом Париж-Сюд, университетом имени Мон Пелье, французским аграрным институтом (Реймс), в Польше – с Силезским университетом (Катовице), Университетом имени Мари Склодовской-Кюри (Люблин), в России – с Московским государственным университетом, Институтом элементоорганической химии РФ (Москва), Институтом органической химии, Институтом химической физики, Институтом структурной макрокинетики, Институтом человеческого мозга (Санкт-Петербург).