Историк, партийный деятель, доктор философских и исторических наук, профессор, академик АН АССР
Родился 17 июня 1887 года в Шуши. Учился в местном реальном училище. В 1906 году, после окончания школы, уехал в Германию, учился в университетах Йены, Галле и Мюнхена.
В 1913 году А. Иоаннисян окончил Мюнхенский университет и получил степень доктора философских наук. В 1913-1914 гг. служил в Армянской духовной семинарии города Шуши, а в 1914-1917 годах - в Духовной семинарии Геворгян в Эчмиадзине. Параллельно с преподавательской деятельностью проводил научные исследования в библиотеке Эчмиадзина и публиковал их результаты в журнале «Арарат» и в отдельных брошюрах.
А. Иоаннисян был членом Коммунистической партии с 1906 года. В 1918 году, во времена Бакинской коммуны, он возглавлял культурно-просветительский отдел Бакинского Совета, а затем школьный отдел Наркомпроса. После упразднения коммуны он уехал в Москву, где работал заведующим отделом литературы и истории в Наркомате по делам национальностей и одновременно, в 1918-1920 гг., возглавлял армянскую секцию наркомпроса РСФСР. В декабре 1920 года он был назначен народным комиссаром просвещения АССР. Одним из первых документов, подписанных им за время пребывания на этой должности, стал приказ от 17 декабря «О реорганизации Ереванского университета». В 1922-1927 гг. был первым секретарем Коммунистической (большевистской) партии Армении.
В 1921-1927 гг. А. Иоаннисян преподавал в ЕГУ историю армянского народа и ленинизм. В 1927-1937 гг. работал в научных учреждениях Ленинграда и Москвы.
Он также, как и многие другие видные деятели того периода, не избежал репрессий сталинской эпохи. В 1937 году был репрессирован, после возвращения из ссылки в 1949 году вынужденно проживал в Кировакане (ныне Ванадзор) в течение пяти лет.
В 1954 году А. Иоаннисян приступил к работе старшим научным сотрудником в Институте истории АН АССР.
В 1955 году защитил докторскую диссертацию. В 1960 году был избран академиком АН АССР, с 1961 года возглавлял отдел Новой истории Института истории.
А. Иоаннисян оставил богатое научное наследие: «Исраэль Ори и армянская освободительная идея» (нем., Мюнхен, 1913), «К вопросу о возникновении русской ориентации у армян» (Эчмиадзин, 1921), «Очерки истории армянской освободительной мысли» (Ер., 1957, 1959), особенно важны двухтомные монографии «Налбандян и его время» (Ер., 1955, 1956) и обширное предисловие к сборнику документов «Армяно-русские отношения в первой трети XVIII века» (рус., Ер., 1967).
Под его научным руководством выросла целая плеяда историков.
В 1967 году был награжден Орденом Ленина.
Скончался 11 июня 1972 года в Ереване.
Бронзовый бюст А. Иоаннисяна в фойе центрального корпуса ЕГУ символизирует роль выдающегося партийного деятеля, учёного и педагога в основании и становлении университета.
